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尊龙凯时基因组DNA提取实验准备

发布时间:2025-03-03   信息来源:尊龙凯时官方编辑

在细菌基因组DNA提取的实验中,经过细菌的培养和收集,我们已获得了足够数量的菌体。接下来,将进入实验的关键步骤——细胞裂解。此步骤旨在破坏细菌的细胞壁和细胞膜,从而释放内部的DNA。我们采用化学与物理结合的方法,首先使用特定的酶类处理样品,这些酶能够特异性分解细菌细胞壁的成分,接着通过超声波或法式压碎法进一步破裂细胞,确保DNA的充分释放。

尊龙凯时基因组DNA提取实验准备

完成细胞裂解后,接下来的挑战是如何有效地分离和纯化DNA。在这一阶段,我们利用DNA在不同盐浓度和pH值下的溶解度差异,通过一系列有机溶剂的抽提步骤,有效去除蛋白质和多糖等杂质,同时保护DNA免受降解。每一步操作都需谨慎,避免剧烈振荡,以防止DNA断裂。

实验步骤

一、试剂盒组成、贮存与稳定性

1. 说明书,耗材:DNA制备管、小量滤器、2ml离心管、15ml离心管。

2. RNaseA:50mg/ml,室温保存。

3. *:50%甘油溶解*,使浓度达到50mg/ml,-20℃密闭贮存。

4. BufferS:细菌原生质制备液,加入RNaseA后,4℃密闭贮存。

5. 025MEDTA:室温密闭贮存。

6. BufferG-A:裂解液,室温密闭贮存。

7. BufferG-B:蛋白去除液,室温密闭贮存。

8. BufferDV-A:BufferDV的制备液,请参考实验准备配方,室温密闭贮存。

9. BufferDV:相分离液,室温密闭贮存。

10. BufferBV:DNA结合液,室温密闭贮存。

11. BufferW1:洗涤液,室温密闭贮存。

12. BufferW2concentrate:去盐液。使用前按试剂瓶上的体积加入无水乙醇并混合均匀,室温密闭贮存。可用100%乙醇或95%乙醇。

13. Eluent:25mM Tris-HCl,pH 8.5,室温密闭贮存。

二、实验准备

1. 每次使用时,在BufferW2中按试剂瓶上的体积加入无水乙醇并混合均匀。

2. 准备BufferDV:取2ml BufferDV-A和125ml异丙醇,混合均匀后加入提供的250ml试剂瓶中。

3. 预冷BufferDV至4℃。

4. 每次使用试剂盒时,使用50%甘油溶解*,使浓度达到50mg/ml。

5. 每次使用试剂盒时,将随试剂盒提供的RNaseA全部加入BufferS中,混合均匀。

6. 准备65℃水浴以加热。

7. 检查BufferG-A和BufferG-B,如有沉淀,结晶可在65℃水浴中加热至其完全溶解后再使用。

8. 将Eluent或去离子水加热至65℃以提高基因组DNA的洗脱效果。

三、操作步骤

1. 用2ml离心管收集10×109(1ml菌液OD600为1-1.5)的细菌培养物,12000×g离心30s,弃掉上清液。用150μl已加入RNaseA的BufferS悬浮沉淀。

2. 确保RNaseA已加入BufferS中,悬浮需均匀,避免小菌块影响溶菌效果。

3. 加入20μl*贮存液,混合均匀,室温静置5min。

4. 加入30μl 025MEDTA(pH 8.0),混合均匀,冰浴5min。

5. 加入450μl BufferG-A,旋涡振荡15s,在65℃水浴下加热10min。

6. 加入400μl BufferG-B和1ml BufferDV(4℃预冷),用力混合,12000×g离心2min。

7. 尽量丢弃上相,保留相间沉淀和下相。加入1ml 4℃预冷的BufferDV,用力混合,12000×g离心2min。

8. 丢弃上相,将下相转移至滤器中(滤器置于2ml离心管内),12000×g离心1min。

9. 在滤液中加入400μl BufferBV,混合均匀。

步骤 10-12可选择负压法或离心法进行。

A. 负压法

10A. 将制备管插入负压装置中,移入步骤8中的混合液,开启并调节负压至-20至-30英寸汞柱,吸尽管中溶液。

11A. 在负压下,加入500μl BufferW1,吸尽管中溶液。

12A. 在负压下沿管壁四周加入700μl BufferW2,吸尽管中溶液;重复一次以确保清洗彻底。

13A. 将制备管置于2ml离心管中,12000×g离心1min。

B. 离心法

10B. 将步骤8中的混合液移入制备管中,12000×g离心1min。

11B. 弃去滤液,将制备管置回原2ml离心管中,加入500μl BufferW1,12000×g离心1min。

12B. 弃去滤液,将制备管置回原2ml离心管,加入700μl BufferW2,12000×g离心1min;再重复一次以确保盐分全面清除。

13B. 弃去滤液,将制备管放入干净的15ml离心管中,在silica膜上加100-200μl Eluent或去离子水,室温静置1min,12000×g离心1min以洗脱DNA。

接下来,通过乙醇沉淀法提取纯化的DNA。这一过程需在低温下进行,以促进DNA的凝聚和沉淀。离心收集沉淀后,使用70%乙醇洗涤数次,以彻底去除残留盐类和有机溶剂,保证DNA的纯度。

最后,将洗涤后的DNA沉淀晾干,溶解于适量的TE缓冲液中,即可获得高纯度的细菌基因组DNA溶液。通过电泳检测,可以直观观察到DNA条带的清晰度和完整性,从而评估提取效果。至此,整个细菌基因组DNA提取实验成功,为后续的分子生物学研究打下了坚实的基础,让我们在生物医疗领域持续迈向新的高度。这一结果也展示了尊龙凯时在生物医学领域的重要性,与科研人员携手共进。